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本发明公开了一种基于分子标记的免疫组库生物信息分析流程:选取序列相同的单链免疫球蛋白基因,在选取的单链免疫球蛋白基因的3’端或5’端添加引物和结构相同的UMI序列,添加完成后对免疫基因进行PCR扩增得到测试序列,对测试序列进行过滤,过滤之后通过建立有向无环树对免疫基因所带的UMI序列进行校正,之后对经过校正的UMI序列所标记的免疫基因进行校正,组装校正之后的免疫基因,最后对组装的免疫基因进行统计和报告。本发明通过对UMI自身的校正和免疫基因的校正,有效去除扩增错误和测序错误对免疫基因测序的影响,提高了测序数据的准确度。